韦小宝隐居云南后，为尽孝心，偷偷随母亲韦春芳回到了扬州，不想却遇到了康熙被天地会围困。机缘巧合之下，韦小宝不仅救了康熙，而且结识了曹雪芹的祖父曹寅。
韦小宝返回京城后，太后从建宁公主口中得知了四十二章经的秘密，准备斩草除根，却被江湖英雄所救。被逼无奈的韦小宝来到鹿鼎山取宝，最终死在了行痴大师的掌下。
却说，韦小宝难以忠义两全，只得带着七个老婆弃官而逃。途经泗阳时，假装遇难，后又领着妻小返回扬州，将母亲韦春芳从丽春院接出，远赴云南，倒也逍遥赛神仙。
然而，韦春芳做惯了皮肉生意，这一闲下来浑身就不自在，又与七个儿媳生了些嫌隙，觉的待在云南特别无趣，于是央求小宝给些钱财，要独自返回扬州。
韦小宝给了母亲大笔银子，让她回去扬州买上十个八个妓院，岂料，韦春芳胸无大志，只买了一家丽春院。
三月后的一天，一位仪态尊贵的富家公子，突然来到丽春院，指名道姓要找韦小宝，韦春花只当是小宝偷了这位达官贵人的银子，现在人家找上门来，于是便想编些谎话来欺骗。
可是那位富家公子的威严气概，竟令韦春花说不出谎话，竹筒倒豆般的将小宝躲在云南的事和盘托出。
忽然，七八条汉子出现在厅堂之上，将富家公子一行五人紧紧围在核心，领头的道长一口一个鞑子皇帝，叫个不停。
原来这富家公子乃是当今皇帝康熙。小宝失踪之后，康熙终是挂念，虽不断派人明察暗访，却无结果。这次听到密报，小宝有可能隐居于桃红柳绿、江南繁华所在扬州城，于是借出巡江南考察河工，微服私访，来到丽春院找寻韦小宝的下落，却不知为何走漏消息，被天地会瞧破了行踪，这才寻上门来。
身为帝王之尊的康熙，生平遭遇过三次险恶，一次是诛灭鳌拜，一次是在清凉寺中，独臂神尼突然现身，再有一次便是归辛树冒死行刺。
然这三回遇险，身边皆有众多侍卫，况且每回遇险都有福将韦小宝忠心护主，是以总能化险为夷，遇难呈祥，然这回却是不同，康熙微服私访，太过托大，轻装简从，只带了多隆、张康年、赵齐贤等四名御前侍卫。
四人哪里是天地会的对手，顷刻之间，便险象环生，亏得康熙自幼习武，左支右绌，这才避开了天地会的玄贞道长几招。
情急之际，康熙忽然口出粗话，让小桂子速速滚出来救驾，青木堂的英雄们，以为这是康熙在万般无奈之下的缓兵之计，自然也就不去理会。
突然，一声嘻笑传来，一位衣着考究，又黑又圆的眼珠子骨碌碌转动的男子，出现在厅堂之上，众人停下手来望去，正是康熙刻意寻找的鹿鼎公韦爵爷，青木堂苦盼的韦香主。一时间，"韦爵爷""韦香主"的叫声不绝于耳。
原来，韦小宝自诩乃是“忠孝节义”之人，如今得罪了小玄子，是为不忠，得罪了天地会，是为不义，如若母亲韦春花再有个三长两短，就是不孝，为了保住这个“孝”字，这才领着一家老小，偷偷返回了扬州。
韦小宝心内打鼓，小玄子与天地会哪里不能见面，偏在自己的窝里大打出手，夹在中间越发不好做人。青木堂众人从韦小宝的言语之中听出，十分维护着康熙，不由微微色变。
自总舵主陈近南被杀之后，康熙大肆宣扬韦小宝剿灭天地会，天地会众人对韦小宝的行事已是大加疑心，后听绿林豪杰茅十八讲述韦小宝如何冒险救人，反清义士顾炎武、吕留良等人讲述韦小宝以特殊身份从事反清复明，这才将心中疑虑稍稍打消。
康熙知道韦小宝诡计多端，机变百出，今日此种局面，只能靠小宝维持，当下就默不作声。玄贞道长旧事重提陈近南遭人暗害之仇。小宝虽将郑克爽整治求生不得，求死不能，但曾答应过师父陈近南，不杀害国姓爷的子孙，小宝实在左右为难，如今玄贞道长旧事重提，心中早已将玄贞道长祖宗八代骂了个遍，于是出了个主意，让他们直接上京城，将郑克爽一刀捅死，祭奠陈近南在天之灵。
天地会众人深知韦小宝的脾性，乃是天底下最大的滑头，十句有九句半靠不住，一个个将信将疑，不置一词。
韦小宝随即指责玄贞道长以下犯上，冒犯自己这个香主，犯了不敬之罪，不想两年前，韦小宝离开天地会，玄贞道长已接任了总舵主之位。
眼看二人说僵，钱老本急忙拦在中间，望韦小宝大人大量，勿要与这一帮粗人一般见识，如今陈近南过世，天地会中能担当起主持大局的重任唯有韦小宝，今日若杀了满清鞑子皇帝，这可是旷古难逢的时机。
就在双方即将谈崩之时，双儿如乳燕掠水般自后边斜掠而至。天地会的英雄大多都知晓，双儿的身世，对她的敬佩，比起对香主韦小宝来，其实倒多有几分。
有了双儿护驾，韦小宝胆子顿时壮了起，突然从怀中摸出两粒骰子，喜笑颜开，言明，如若自己掷出至尊宝，便帮皇帝。
众人都知韦小宝刁钻古怪，一时又不知道他葫芦里卖的什么药，是以大伙皆不吭声。
就在韦小宝口中胡说八道之时，手一伸，便将骰子掷了出去， 骰子在地上转个不停，多隆、张康年等御前侍卫和玄贞道长、钱老本等天地会英雄都紧紧地盯着骰子。一会儿，骰子停止，正是至尊宝。多隆等大喜过望，玄贞道长等则大惊失色。
康熙自幼生在长在皇宫，自然不知什么至尊宝、板凳、长三，但看到多隆的神色，便知韦小宝帮定了自己，不由一颗悬着的心也就放进了肚子里。
天地会本来对韦小宝有诸多疑心，如今他露出了真面目，公然站在康熙一边，失望之余，反倒如释重负。
玄贞道长一看当前形势，天地会占足了赢面，如若退去，实在大为不敢，于是提议，一对一以武定胜负，立判生死，各安天命。
就在这时，韦小宝看到一个弯腰驼背、面目肮脏的女子，端着一盘酒壶酒怀，一声不响地从后面走出，她虽然身着一身破烂的青布夹袄，却掩饰不住窈窕身材，脸上又黑又脏，若是仔细端详，却不难发觉她有秀丽的容颜，韦小宝顿时反应过来，这是他的大夫人苏荃。
韦小宝心中暗喜，却又不敢表现出来，怕露马脚，前功尽弃。即便如此，韦小宝还是忍耐不住，在她腮帮上捏了一把。
韦小宝斟满八杯酒，自端一杯，然后慷概激昂的发表演讲，毕竟与众位兄弟一场，好合好散，干了这杯，兄弟情分，恩断义绝，任你们杀的天昏地暗，自己绝不插手。天地会的英雄依次义无返颐的与韦小宝喝了这杯绝交酒。
随后，韦小宝又将多隆、张康年等招呼过来，喝下了这杯断头酒，好在*泉路上结伴同行，最后又走到康熙面前，啰里啰嗦的说了一大堆，接着放低声音，待会儿打起来，自己可以趁乱设法走掉，随即单腿跪下，双手将酒杯举过头顶，让康熙喝了这杯。康熙接过酒杯，一饮而尽。
玄贞道长早已等的不耐烦，刚要摩拳擦掌，不想一阵头晕目眩，身子晃了起来，韦小宝身子也是一个踉跄，高声叫到酒中有*后，便栽倒在地。紧接着玄贞道长、钱老本等天地会的英雄和康熙与多隆等朝廷中人，相继摔倒在地，昏死过去。
方怡、阿珂、曾柔、沐剑屏、公主一窝蜂地全后堂涌出，与原先就在厅堂上双儿、苏荃，一同扑向小宝。双儿抱住韦小宝泪眼婆娑，不想小宝一个鲤鱼打挺，从双儿怀里坐起来，口中狂呼：大功告成，亲个嘴儿。
原来，就在康熙与韦春芳纠缠之时，韦小宝便领着妻儿悄悄从丽春院后门进来，待看到天地会欲找康熙麻烦，便悄悄与苏荃在酒中下了蒙汗药。
正在韦小宝与夫人们如何处理这帮人之时，忽然一个身影闪了进来，身法之快，与那陈近南、独臂神尼委实不相上下。
韦小宝看那人，头戴花翎，身穿朝服，一身御前侍卫的打扮，于是问其姓甚名谁。
原来此人是一等侍卫、江宁织造曹寅，韦小宝秘密返回扬州，便是此人密报，因见丽春院来了帮形迹可疑之人，遂前来打探，不想竟意外遇到了康熙遭人暗算，躺倒在地。
别看曹寅不显山不露水，实乃内功高深，当世武林几乎无人可敌。曹寅搭脉看相，便知皇帝只是中了蒙汗药，并无大碍，这才放下心来。曹寅知道韦小宝乃是朝廷亲贵，于是遵从其命，速速背起康熙，往江宁织造衙门而去。
曹寅刚去不久，忽然房顶上"轰"地一声，掉下一蒙面人，还没等韦小宝省过神来，那人一把拎起韦小宝，飞身而起，穿越屋顶而去。小宝一时情急，不禁昏死过去。
待到小宝醒来，虽不知自己所处何处，但觉鼻中幽幽一股闺房之香。小宝一生阅女无数，对女子体香深有体会，这不似丽春院的那等粗俗之香，也不似江湖女子粗犷豪放之香，更不似公主身上的那等富贵之香。
就在胡思乱想之时，一个高挑身材，杏眼圆腮，一口吴侬软语的妙龄女子和一位粉装玉琢，眉清目秀，年约六七岁的孩童走了进来，小宝未及细问，曹寅也缓缓走了进来。
原来此处为曹寅府上，那吴侬软语的妙龄女子则是其府上丫鬟，那粉装玉琢的孩童则是曹寅孙子曹雪芹。曹寅见丽春院内反贼众多，救走皇帝后，唯恐反贼伤着韦小宝，于是令其门下弟子，破墙而入将其救出。
曹寅压低声音，宣读了康熙口谕。原来，在小宝在昏迷期间，康熙已命多隆管带领御前侍卫，将其夫人、公子、小姐，全数送往京城公爵府，让他也速速返回京城。
此时韦小宝根本听不进曹寅的马屁之语，心中暗道：小玄子终究还是信不过自己，将自己的夫人小孩拿去做了人质，即便自己认为天下第一滑头，还是逃不脱小玄子的手掌心。
一会儿，韦小宝缓过神来，发觉曹寅有意无意的看着自己，暗道：曹寅也不是什么好东西，其祖上定然是大花脸曹操的后代，奉皇帝之命前来监视自己。
韦小宝唯恐曹寅起疑，随即将话锋转到身边站立的曹雪芹身上。曹雪芹一反原先那娇惯的样子，恭恭敬敬地给小宝磕了个头。小宝顺手掏出一迭银票，当做见面礼，递给小雪芹，让他买糖去吃。
第二日，韦小宝孤身前往京城。皇宫中，韦小宝与康熙再度见面，康熙异常激动，告诉他公主一回京城，便被太后接了去。二人来到慈宁宫，还未进门，便听到建宁公主与女儿韦双双的嬉笑声。
小宝大惑不解，建宁公主是用什么方法讨得太后欢心，这拍马屁的功夫，倒是可以好好学上一学。建宁公主见的小宝，仍一如既往的冲了上来，揪住韦小宝的耳朵，痛斥其为何来的这们晚，幸亏太后发言，小宝才躲过一劫。面对着这个冒牌的丈母娘，小宝实在想不出到底为何。
待到建宁公主说自己为修身养性，每日和太后吟诵《四十二章经》时，吓得*飞魄散。这十年来匪夷所思的经历，升官晋爵，所遇的灾难艰险，可以说全是拜《四十二章经》所赐。
小宝明明记得，自己和双儿取出经书中藏的地图后，将经书交给皇上，已经销毁，当看到太后案头的那部《四十二章经》时，心中不由一颤。
这次重出江湖，不比往昔，往昔既有天地会作为后盾，又拜独臂神尼为师，可以说江湖行走之时，一呼百应，处处受人敬重，但此时却大不相同，陈近南已死，天地会群龙无首，形同解体，又与天地会的英雄们心生嫌隙，是以小宝每日躲在公爵府中，与七位夫人呷醋落盐，饮酒作乐。
这日，康熙突然问起小宝《四十二章经》之事，小宝只说昔日已全交给皇上销毁。不想康熙竟说，小宝从经书里拿了什么，赶快从实招来。
韦小宝恍然大悟，定是那建宁公主被太后套话，得知了夹层中藏有东西，但却不知是藏宝图，小宝装出一脸委屈之至的苦相，希望能骗过皇上，不想康熙断然不听，昔日康熙那张纯正无邪的脸，已变得威严冷峻，额头上过早出现的皱纹，隐藏着过多的猜忌和不信任。
康熙皇帝已经不是昔日的小玄子了！康熙随即下令将韦小宝全家押入天牢，这时，韦小宝才觉察出了事情的严重。
事到如今，韦小宝索性也就不去多想，进了天牢，一眼就看到了七个面带愁容、靡不振的老婆。韦小宝知道，七个老婆中唯有苏荃有本事做过大事，随即悄声将此事和盘托出。
苏荃知道此事干系重大，只有不说才能活命，至于将来只能伺机而待。韦小宝本就是个随遇而安之人，听闻苏荃之言后，便整日与七个老婆在天牢中掷骰赌博，偶尔想到七个如花似玉的老婆和虎头兄妹陪自己共赴*泉，未免也太可惜。韦小宝知道这一回谁也靠不住，只能靠自己设法，离开险地。
就在这时，太监拿来太后赐下的*酒，让众人去喝，小宝一脚踢翻，心中极是后悔，当初不该救这真太后，叫她一辈子被毛东珠关在墙洞，也能免去自己一家子去喝*酒。
韦小宝哪里会相信，那个温文尔雅的太后，居然这般阴险狠辣，竟会逼迫她的救命恩人去服*。
就在太监逼迫韦小宝喝下*酒之时，康熙在多隆等众多御前侍卫的护卫下来到了天牢。康熙大怒，让太监自己喝下*酒，就算太监们磕头如捣蒜，康熙也不为所动。
康熙与小宝在天牢中，一番互忆当年情谊，互相落泪之后，康熙颁下旨意，从即日起，没有皇帝的亲笔旨意，任何人不得来到这里。
这一日，韦小宝忽然从众多御前侍卫中发现了曹寅，不禁大喜，就在小宝和他打招呼之时，不想曹寅神情麻木，不识一般，低头走了过去。韦小宝又是祖宗八代的问候。
五日过后，两个御前侍卫换班，其中一个便是曹寅，忽然曹寅似困极了一般，伸出双手，忽然在另外一个侍卫身上连点了数处穴道。
原来，曹寅前日里怕人多嘴杂，这才没有打招呼，而且联系了九难师太、玄贞道长、钱老本、茅十八、洪安通等有头有脸，名气大小不一，百十口人江湖人物，准备劫狱，条件却是平分藏宝图上的宝物和毁了大清龙脉。小宝想都没想，直接答应。
第二日午夜，韦小宝早早就叫七位夫人准备好，曹寅将其余侍卫，以重手点了穴道，忽然传来一阵脚步声，曹寅听出这些人脚步虚浮，绝不是武林中人，只怕事情有变，于是将点倒的侍卫拖到僻静之所。刚刚做完这些，便听有人喊道：皇太后驾到。曹寅见小宝吓得*魄出窍，悄声安慰后，疾步出门，迎接太后圣驾。
太后站立在韦小宝面前，目光冷峻，随后带上三四十人，问韦小宝可曾认识，小宝一脸茫然。
忽然，这三四十人乱七八糟，叽里咕噜的说出一连串满语：额尔古纳河、精奇里江、呼玛尔窝集山，韦小宝顿时明白了一切。原来，太后把那些将满洲地名译成汉文的笔帖，已全部抓来。
小宝笑到太后做事周全，太后叹了口气说出，事关大清江山，牵扯到爱新觉罗的天下，只能这般。太后向身后的太监递了个眼色，那帮太监人手一把匕首，手起刀落，那三四十个还不知到底发生了什么事的笔帖，便已被全部处死。即便是杀人不眨眼的苏荃，看到此种状况，也不禁倒吸一口凉气。
小宝此时已经明白太后心意，是要将所有知道藏宝图的人，斩草除根，以保大清龙脉安全。
那些太监忽然手握滴血的匕首，同时向小宝一家人抢了过来。最前一个太监，匕首朝着韦小宝，当胸刺到。建宁公主，欺身而上，挡在小宝面前，以女儿的身份恳请太后，放过他们一家。
太后哈哈大笑，说建宁不配叫她额娘，她根本不是什么金枝玉叶，而是叛逆毛东珠的女儿。建宁一听，心里顿时明白，口中不停喃喃怪不得。
就在这时，一个中年尼姑闪到太后身后，并用拂尘抵在背心要穴，小宝顿时大喜，连叫师父。此人正是九难师太。随后，呼啦冲进了几十个人来，小宝定睛一看，正是玄贞道长、钱老本、洪安通个等人。
九难师太押着太后在前，众英雄护着韦小宝一家走在中间，洪安通、玄贞道长、曹寅等高手断后，浩浩荡荡，出了京城。
忽然，一声号角，无数官兵手持弓箭、火器，将众人围得水泄不通，即便众人都是见过大阵仗之人，此刻也不禁微微色变。
康熙缓缓而出，让小宝放了太后，不想就在此时，太后狂喊，自古忠孝不能两全，尽忠难得尽孝，尽孝难得尽忠，为了大清江山，需将反贼，尽数击毙。此时的太后，看似瘦弱、纤细，眼里显现出来的，竟是一股震慑人心的凛然正气，接着痛斥康熙，自己的命哪里抵得上大清江山，让其速速动手，太后还要说话，九难师太手腕微微抖动，点了她的哑穴。
经过此番变故，韦小宝对康熙、太后仅存的一点儿幻想彻底破灭。康熙思量片刻，喝令御林*让开，放众人过去。一行人出了京城，在城外接应的人早已雇好了马车、马匹，放了太后之后，大伙星夜向关外疾驰。一路上，众人马不停蹄，昼夜兼程，一月之后便来到了鹿鼎山。
这鹿鼎山乃是关外极北之地，逶迤百里，高耸入云，险峻无比，小宝带着众人在这大山之中转来转去，开始寻找藏宝之所。忽然，众人发现群山环抱之中，显现出一只红砖琉璃屋角，接着就听到了和尚诵经的声音。众人急奔过去，寺院门匾上，赫然写着："大悲寺"。
就在这时，漫山遍野，密密麻麻的清兵突然现身，声震如雷，将众人围得水泄不通，一尊尊红衣大炮，也瞄准了群雄。小宝甚是奇怪，何人暴露了他们行踪，就在这时，曹寅突然出手，抓住小宝，向山上疾奔。群豪猝不及防，救援已是不及。
康熙小宝再度见面，康熙叹息一声，自己若是和小宝一样生在扬州，那就可以一起喝酒、赌钱，可是生在帝王之家，身为一国之君，也就顾不得什么江湖道义、儿女情长。
原来，康熙为了能一举消灭反清逆贼，于是命曹寅将鹿鼎山藏宝图的秘密广为传开，以此来引诱江湖群雄来劫狱救人，不想中途出了差错，太后被挟持。
就在康熙命令开炮之时，一位身披大红袈裟，轻功极佳的和尚跃了过来。小宝一看，居然是康熙的生父以前的顺治皇帝，现在的行痴大师。
行痴大师得知康熙因鹿鼎山藏宝图而要诛杀叛逆，甚是不满，要坐牢江山，只须牢记“永不加赋”四字便可，与龙脉何干，何以乱伤人命？一时间，康熙哑言。
行痴得知鹿鼎山藏宝图的秘密只有韦小宝一人所知时，忽然手起一掌，拍在韦小宝顶门的百会穴上，小宝大叫一声，身子一瘫，倒地身亡。
若干年之后，江湖风起云涌，再起波澜，韦虎头与韦双双姊妹，踏遍三山五岳，非要找寻一个法号行痴的和尚。
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